Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUD5

ZCCHC3, Zinc finger CCHC domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC3Q9NUD5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZCCHC3Q9NUD5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZCCHC3Q9NUD5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZCCHC3Q9NUD5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZCCHC3Q9NUD5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZCCHC3Q9NUD5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZCCHC3Q9NUD5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZCCHC3Q9NUD5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZCCHC3Q9NUD5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZCCHC3Q9NUD5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZCCHC3Q9NUD5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZCCHC3Q9NUD5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ZCCHC3Q9NUD5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZCCHC3Q9NUD5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZCCHC3Q9NUD5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZCCHC3Q9NUD5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZCCHC3Q9NUD5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZCCHC3Q9NUD5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZCCHC3Q9NUD5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZCCHC3Q9NUD5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZCCHC3Q9NUD5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZCCHC3Q9NUD5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZCCHC3Q9NUD5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZCCHC3Q9NUD5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZCCHC3Q9NUD5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZCCHC3Q9NUD5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZCCHC3Q9NUD5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZCCHC3Q9NUD5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZCCHC3Q9NUD5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZCCHC3Q9NUD5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZCCHC3Q9NUD5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZCCHC3Q9NUD5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZCCHC3Q9NUD5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZCCHC3Q9NUD5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZCCHC3Q9NUD5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZCCHC3Q9NUD5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZCCHC3Q9NUD5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZCCHC3Q9NUD5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZCCHC3Q9NUD5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZCCHC3Q9NUD5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZCCHC3Q9NUD5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZCCHC3Q9NUD5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZCCHC3Q9NUD5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZCCHC3Q9NUD5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZCCHC3Q9NUD5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZCCHC3Q9NUD5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZCCHC3Q9NUD5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZCCHC3Q9NUD5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZCCHC3Q9NUD5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
ZCCHC3Q9NUD5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZCCHC3Q9NUD5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZCCHC3Q9NUD5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZCCHC3Q9NUD5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZCCHC3Q9NUD5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZCCHC3Q9NUD5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZCCHC3Q9NUD5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZCCHC3Q9NUD5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZCCHC3Q9NUD5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZCCHC3Q9NUD5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZCCHC3Q9NUD5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZCCHC3Q9NUD5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZCCHC3Q9NUD5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZCCHC3Q9NUD5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZCCHC3Q9NUD5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZCCHC3Q9NUD5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZCCHC3Q9NUD5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZCCHC3Q9NUD5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZCCHC3Q9NUD5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZCCHC3Q9NUD5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZCCHC3Q9NUD5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZCCHC3Q9NUD5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZCCHC3Q9NUD5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZCCHC3Q9NUD5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZCCHC3Q9NUD5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZCCHC3Q9NUD5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZCCHC3Q9NUD5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZCCHC3Q9NUD5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZCCHC3Q9NUD5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZCCHC3Q9NUD5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZCCHC3Q9NUD5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZCCHC3Q9NUD5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZCCHC3Q9NUD5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZCCHC3Q9NUD5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZCCHC3Q9NUD5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZCCHC3Q9NUD5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZCCHC3Q9NUD5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZCCHC3Q9NUD5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ZCCHC3Q9NUD5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZCCHC3Q9NUD5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZCCHC3Q9NUD5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZCCHC3Q9NUD5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZCCHC3Q9NUD5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZCCHC3Q9NUD5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ZCCHC3Q9NUD5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZCCHC3Q9NUD5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZCCHC3Q9NUD5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZCCHC3Q9NUD5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZCCHC3Q9NUD5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZCCHC3Q9NUD5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZCCHC3Q9NUD5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms