Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms