Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms