Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARHGEF3Q9NR81 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARHGEF3Q9NR81 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF3Q9NR81 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF3Q9NR81 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF3Q9NR81 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF3Q9NR81 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF3Q9NR81 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF3Q9NR81 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF3Q9NR81 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF3Q9NR81 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF3Q9NR81 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF3Q9NR81 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF3Q9NR81 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF3Q9NR81 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF3Q9NR81 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF3Q9NR81 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF3Q9NR81 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF3Q9NR81 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF3Q9NR81 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF3Q9NR81 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF3Q9NR81 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF3Q9NR81 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF3Q9NR81 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF3Q9NR81 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF3Q9NR81 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF3Q9NR81 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF3Q9NR81 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF3Q9NR81 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF3Q9NR81 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF3Q9NR81 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF3Q9NR81 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF3Q9NR81 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF3Q9NR81 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF3Q9NR81 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF3Q9NR81 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF3Q9NR81 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF3Q9NR81 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF3Q9NR81 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF3Q9NR81 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF3Q9NR81 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF3Q9NR81 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF3Q9NR81 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF3Q9NR81 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGEF3Q9NR81 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGEF3Q9NR81 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGEF3Q9NR81 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGEF3Q9NR81 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGEF3Q9NR81 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGEF3Q9NR81 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGEF3Q9NR81 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGEF3Q9NR81 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGEF3Q9NR81 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGEF3Q9NR81 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGEF3Q9NR81 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGEF3Q9NR81 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGEF3Q9NR81 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGEF3Q9NR81 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGEF3Q9NR81 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms