Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms