Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP79

VTA1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTA1Q9NP79 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
VTA1Q9NP79 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms