Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms