Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP71

MLXIPL, Carbohydrate-responsive element-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLXIPLQ9NP71 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MLXIPLQ9NP71 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MLXIPLQ9NP71 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MLXIPLQ9NP71 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MLXIPLQ9NP71 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MLXIPLQ9NP71 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MLXIPLQ9NP71 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MLXIPLQ9NP71 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MLXIPLQ9NP71 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MLXIPLQ9NP71 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MLXIPLQ9NP71 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MLXIPLQ9NP71 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MLXIPLQ9NP71 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MLXIPLQ9NP71 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MLXIPLQ9NP71 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MLXIPLQ9NP71 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MLXIPLQ9NP71 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MLXIPLQ9NP71 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MLXIPLQ9NP71 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MLXIPLQ9NP71 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MLXIPLQ9NP71 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MLXIPLQ9NP71 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MLXIPLQ9NP71 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MLXIPLQ9NP71 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MLXIPLQ9NP71 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MLXIPLQ9NP71 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MLXIPLQ9NP71 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MLXIPLQ9NP71 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms