Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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