Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms