Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
VAT1LQ9HCJ6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms