Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9C1

VIPAS39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPAS39Q9H9C1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VIPAS39Q9H9C1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VIPAS39Q9H9C1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VIPAS39Q9H9C1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VIPAS39Q9H9C1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VIPAS39Q9H9C1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VIPAS39Q9H9C1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VIPAS39Q9H9C1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VIPAS39Q9H9C1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VIPAS39Q9H9C1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VIPAS39Q9H9C1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VIPAS39Q9H9C1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VIPAS39Q9H9C1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VIPAS39Q9H9C1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VIPAS39Q9H9C1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VIPAS39Q9H9C1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VIPAS39Q9H9C1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VIPAS39Q9H9C1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VIPAS39Q9H9C1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VIPAS39Q9H9C1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VIPAS39Q9H9C1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VIPAS39Q9H9C1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms