Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms