Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCSER1Q9C0I3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
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