Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE4

GTPBP4, Nucleolar GTP-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP4Q9BZE4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTPBP4Q9BZE4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTPBP4Q9BZE4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTPBP4Q9BZE4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTPBP4Q9BZE4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTPBP4Q9BZE4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTPBP4Q9BZE4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTPBP4Q9BZE4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTPBP4Q9BZE4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTPBP4Q9BZE4 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTPBP4Q9BZE4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTPBP4Q9BZE4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTPBP4Q9BZE4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTPBP4Q9BZE4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTPBP4Q9BZE4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTPBP4Q9BZE4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTPBP4Q9BZE4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTPBP4Q9BZE4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTPBP4Q9BZE4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTPBP4Q9BZE4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTPBP4Q9BZE4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTPBP4Q9BZE4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTPBP4Q9BZE4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTPBP4Q9BZE4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTPBP4Q9BZE4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTPBP4Q9BZE4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTPBP4Q9BZE4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTPBP4Q9BZE4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTPBP4Q9BZE4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTPBP4Q9BZE4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTPBP4Q9BZE4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTPBP4Q9BZE4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTPBP4Q9BZE4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GTPBP4Q9BZE4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTPBP4Q9BZE4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTPBP4Q9BZE4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTPBP4Q9BZE4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTPBP4Q9BZE4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms