Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
YTHDF1Q9BYJ9 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms