Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ1

C1QTNF1, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF1Q9BXJ1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C1QTNF1Q9BXJ1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C1QTNF1Q9BXJ1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C1QTNF1Q9BXJ1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1QTNF1Q9BXJ1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms