Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX40

LSM14B, Protein LSM14 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM14BQ9BX40 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms