Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SYCP2Q9BX26 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SYCP2Q9BX26 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SYCP2Q9BX26 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SYCP2Q9BX26 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SYCP2Q9BX26 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SYCP2Q9BX26 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SYCP2Q9BX26 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
SYCP2Q9BX26 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SYCP2Q9BX26 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SYCP2Q9BX26 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SYCP2Q9BX26 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SYCP2Q9BX26 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SYCP2Q9BX26 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SYCP2Q9BX26 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
SYCP2Q9BX26 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SYCP2Q9BX26 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SYCP2Q9BX26 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SYCP2Q9BX26 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
SYCP2Q9BX26 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
SYCP2Q9BX26 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
SYCP2Q9BX26 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SYCP2Q9BX26 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
SYCP2Q9BX26 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
SYCP2Q9BX26 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
SYCP2Q9BX26 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SYCP2Q9BX26 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SYCP2Q9BX26 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SYCP2Q9BX26 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
SYCP2Q9BX26 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SYCP2Q9BX26 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SYCP2Q9BX26 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
SYCP2Q9BX26 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
SYCP2Q9BX26 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
SYCP2Q9BX26 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SYCP2Q9BX26 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
SYCP2Q9BX26 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
SYCP2Q9BX26 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SYCP2Q9BX26 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SYCP2Q9BX26 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SYCP2Q9BX26 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
SYCP2Q9BX26 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
SYCP2Q9BX26 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SYCP2Q9BX26 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SYCP2Q9BX26 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SYCP2Q9BX26 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
SYCP2Q9BX26 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
SYCP2Q9BX26 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SYCP2Q9BX26 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SYCP2Q9BX26 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SYCP2Q9BX26 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SYCP2Q9BX26 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SYCP2Q9BX26 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms