Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV29

CCDC32, Coiled-coil domain-containing protein 32, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC32Q9BV29 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC32Q9BV29 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms