Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms