Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX3

TMEM208, Transmembrane protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208Q9BTX3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM208Q9BTX3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM208Q9BTX3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM208Q9BTX3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM208Q9BTX3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM208Q9BTX3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM208Q9BTX3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM208Q9BTX3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM208Q9BTX3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM208Q9BTX3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM208Q9BTX3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM208Q9BTX3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms