Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MCMBPQ9BTE3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms