Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT09

CNPY3, Protein canopy homolog 3, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY3Q9BT09 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNPY3Q9BT09 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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