Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP4

PAAF1, Proteasomal ATPase-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAAF1Q9BRP4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms