Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms