Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SPOCK3Q9BQ16 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPOCK3Q9BQ16 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPOCK3Q9BQ16 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPOCK3Q9BQ16 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPOCK3Q9BQ16 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPOCK3Q9BQ16 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPOCK3Q9BQ16 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPOCK3Q9BQ16 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPOCK3Q9BQ16 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPOCK3Q9BQ16 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPOCK3Q9BQ16 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPOCK3Q9BQ16 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPOCK3Q9BQ16 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPOCK3Q9BQ16 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPOCK3Q9BQ16 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPOCK3Q9BQ16 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPOCK3Q9BQ16 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPOCK3Q9BQ16 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPOCK3Q9BQ16 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPOCK3Q9BQ16 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPOCK3Q9BQ16 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPOCK3Q9BQ16 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPOCK3Q9BQ16 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPOCK3Q9BQ16 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SPOCK3Q9BQ16 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPOCK3Q9BQ16 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPOCK3Q9BQ16 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPOCK3Q9BQ16 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SPOCK3Q9BQ16 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPOCK3Q9BQ16 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPOCK3Q9BQ16 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPOCK3Q9BQ16 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPOCK3Q9BQ16 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPOCK3Q9BQ16 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPOCK3Q9BQ16 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms