Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPX3

NCAPG, Condensin complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPGQ9BPX3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCAPGQ9BPX3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCAPGQ9BPX3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCAPGQ9BPX3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCAPGQ9BPX3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCAPGQ9BPX3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCAPGQ9BPX3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCAPGQ9BPX3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCAPGQ9BPX3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NCAPGQ9BPX3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCAPGQ9BPX3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCAPGQ9BPX3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCAPGQ9BPX3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NCAPGQ9BPX3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCAPGQ9BPX3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCAPGQ9BPX3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCAPGQ9BPX3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCAPGQ9BPX3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCAPGQ9BPX3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCAPGQ9BPX3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCAPGQ9BPX3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCAPGQ9BPX3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCAPGQ9BPX3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCAPGQ9BPX3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCAPGQ9BPX3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCAPGQ9BPX3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCAPGQ9BPX3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCAPGQ9BPX3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCAPGQ9BPX3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCAPGQ9BPX3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCAPGQ9BPX3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NCAPGQ9BPX3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCAPGQ9BPX3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCAPGQ9BPX3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCAPGQ9BPX3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCAPGQ9BPX3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms