Protein–RNA interactions for Protein: Q99999

GAL3ST1, Galactosylceramide sulfotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST1Q99999 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GAL3ST1Q99999 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GAL3ST1Q99999 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GAL3ST1Q99999 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GAL3ST1Q99999 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GAL3ST1Q99999 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GAL3ST1Q99999 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GAL3ST1Q99999 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GAL3ST1Q99999 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GAL3ST1Q99999 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GAL3ST1Q99999 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GAL3ST1Q99999 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GAL3ST1Q99999 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GAL3ST1Q99999 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GAL3ST1Q99999 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GAL3ST1Q99999 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GAL3ST1Q99999 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GAL3ST1Q99999 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GAL3ST1Q99999 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GAL3ST1Q99999 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GAL3ST1Q99999 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GAL3ST1Q99999 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GAL3ST1Q99999 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GAL3ST1Q99999 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GAL3ST1Q99999 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GAL3ST1Q99999 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GAL3ST1Q99999 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GAL3ST1Q99999 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GAL3ST1Q99999 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GAL3ST1Q99999 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GAL3ST1Q99999 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GAL3ST1Q99999 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GAL3ST1Q99999 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GAL3ST1Q99999 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GAL3ST1Q99999 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GAL3ST1Q99999 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GAL3ST1Q99999 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GAL3ST1Q99999 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GAL3ST1Q99999 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GAL3ST1Q99999 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GAL3ST1Q99999 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GAL3ST1Q99999 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GAL3ST1Q99999 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GAL3ST1Q99999 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GAL3ST1Q99999 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GAL3ST1Q99999 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GAL3ST1Q99999 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GAL3ST1Q99999 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GAL3ST1Q99999 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GAL3ST1Q99999 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GAL3ST1Q99999 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GAL3ST1Q99999 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GAL3ST1Q99999 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GAL3ST1Q99999 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GAL3ST1Q99999 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GAL3ST1Q99999 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GAL3ST1Q99999 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GAL3ST1Q99999 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GAL3ST1Q99999 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GAL3ST1Q99999 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GAL3ST1Q99999 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GAL3ST1Q99999 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GAL3ST1Q99999 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GAL3ST1Q99999 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GAL3ST1Q99999 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GAL3ST1Q99999 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GAL3ST1Q99999 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GAL3ST1Q99999 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GAL3ST1Q99999 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GAL3ST1Q99999 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GAL3ST1Q99999 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GAL3ST1Q99999 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GAL3ST1Q99999 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GAL3ST1Q99999 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GAL3ST1Q99999 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GAL3ST1Q99999 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GAL3ST1Q99999 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GAL3ST1Q99999 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GAL3ST1Q99999 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GAL3ST1Q99999 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GAL3ST1Q99999 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GAL3ST1Q99999 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GAL3ST1Q99999 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GAL3ST1Q99999 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GAL3ST1Q99999 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GAL3ST1Q99999 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GAL3ST1Q99999 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GAL3ST1Q99999 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GAL3ST1Q99999 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GAL3ST1Q99999 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GAL3ST1Q99999 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GAL3ST1Q99999 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GAL3ST1Q99999 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GAL3ST1Q99999 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GAL3ST1Q99999 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GAL3ST1Q99999 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GAL3ST1Q99999 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GAL3ST1Q99999 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GAL3ST1Q99999 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GAL3ST1Q99999 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms