Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB3IPQ96QF0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB3IPQ96QF0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB3IPQ96QF0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB3IPQ96QF0 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB3IPQ96QF0 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB3IPQ96QF0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB3IPQ96QF0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3IPQ96QF0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3IPQ96QF0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3IPQ96QF0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3IPQ96QF0 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3IPQ96QF0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3IPQ96QF0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3IPQ96QF0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3IPQ96QF0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3IPQ96QF0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3IPQ96QF0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3IPQ96QF0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3IPQ96QF0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3IPQ96QF0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3IPQ96QF0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB3IPQ96QF0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms