Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
YTHDC1Q96MU7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
YTHDC1Q96MU7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
YTHDC1Q96MU7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
YTHDC1Q96MU7 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
YTHDC1Q96MU7 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
YTHDC1Q96MU7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
YTHDC1Q96MU7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
YTHDC1Q96MU7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
YTHDC1Q96MU7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
YTHDC1Q96MU7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
YTHDC1Q96MU7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
YTHDC1Q96MU7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
YTHDC1Q96MU7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
YTHDC1Q96MU7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
YTHDC1Q96MU7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
YTHDC1Q96MU7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
YTHDC1Q96MU7 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
YTHDC1Q96MU7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
YTHDC1Q96MU7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
YTHDC1Q96MU7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
YTHDC1Q96MU7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
YTHDC1Q96MU7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
YTHDC1Q96MU7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
YTHDC1Q96MU7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
YTHDC1Q96MU7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
YTHDC1Q96MU7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
YTHDC1Q96MU7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
YTHDC1Q96MU7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
YTHDC1Q96MU7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
YTHDC1Q96MU7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
YTHDC1Q96MU7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
YTHDC1Q96MU7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
YTHDC1Q96MU7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
YTHDC1Q96MU7 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
YTHDC1Q96MU7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
YTHDC1Q96MU7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
YTHDC1Q96MU7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
YTHDC1Q96MU7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
YTHDC1Q96MU7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms