Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM20AQ96MK3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms