Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C9orf72Q96LT7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms