Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms