Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms