Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms