Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDLIM2Q96JY6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms