Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms