Protein–RNA interactions for Protein: Q96ET8

TVP23C, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog C, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23CQ96ET8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms