Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM44Q96DX7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM44Q96DX7 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.9 ms