Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms