Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB9

NSUN4, 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN4Q96CB9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSUN4Q96CB9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
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