Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFT1Q96AA3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFT1Q96AA3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFT1Q96AA3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFT1Q96AA3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFT1Q96AA3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RFT1Q96AA3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFT1Q96AA3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RFT1Q96AA3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFT1Q96AA3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFT1Q96AA3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFT1Q96AA3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFT1Q96AA3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFT1Q96AA3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFT1Q96AA3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFT1Q96AA3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RFT1Q96AA3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFT1Q96AA3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFT1Q96AA3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFT1Q96AA3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFT1Q96AA3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFT1Q96AA3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFT1Q96AA3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFT1Q96AA3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFT1Q96AA3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFT1Q96AA3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms