Protein–RNA interactions for Protein: Q96A49

SYAP1, Synapse-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYAP1Q96A49 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYAP1Q96A49 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYAP1Q96A49 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYAP1Q96A49 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYAP1Q96A49 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYAP1Q96A49 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYAP1Q96A49 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYAP1Q96A49 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYAP1Q96A49 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYAP1Q96A49 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYAP1Q96A49 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYAP1Q96A49 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYAP1Q96A49 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYAP1Q96A49 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYAP1Q96A49 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYAP1Q96A49 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYAP1Q96A49 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYAP1Q96A49 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYAP1Q96A49 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYAP1Q96A49 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYAP1Q96A49 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYAP1Q96A49 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYAP1Q96A49 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYAP1Q96A49 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYAP1Q96A49 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYAP1Q96A49 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYAP1Q96A49 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYAP1Q96A49 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYAP1Q96A49 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYAP1Q96A49 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYAP1Q96A49 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYAP1Q96A49 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYAP1Q96A49 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYAP1Q96A49 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYAP1Q96A49 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SYAP1Q96A49 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYAP1Q96A49 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYAP1Q96A49 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYAP1Q96A49 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYAP1Q96A49 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYAP1Q96A49 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYAP1Q96A49 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYAP1Q96A49 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYAP1Q96A49 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SYAP1Q96A49 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYAP1Q96A49 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYAP1Q96A49 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYAP1Q96A49 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYAP1Q96A49 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYAP1Q96A49 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYAP1Q96A49 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYAP1Q96A49 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYAP1Q96A49 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYAP1Q96A49 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SYAP1Q96A49 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYAP1Q96A49 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYAP1Q96A49 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYAP1Q96A49 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYAP1Q96A49 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYAP1Q96A49 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYAP1Q96A49 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYAP1Q96A49 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYAP1Q96A49 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SYAP1Q96A49 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYAP1Q96A49 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYAP1Q96A49 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYAP1Q96A49 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYAP1Q96A49 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYAP1Q96A49 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYAP1Q96A49 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYAP1Q96A49 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYAP1Q96A49 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYAP1Q96A49 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYAP1Q96A49 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYAP1Q96A49 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYAP1Q96A49 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYAP1Q96A49 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYAP1Q96A49 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYAP1Q96A49 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYAP1Q96A49 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYAP1Q96A49 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYAP1Q96A49 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYAP1Q96A49 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYAP1Q96A49 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYAP1Q96A49 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYAP1Q96A49 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYAP1Q96A49 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYAP1Q96A49 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYAP1Q96A49 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYAP1Q96A49 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYAP1Q96A49 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYAP1Q96A49 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYAP1Q96A49 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYAP1Q96A49 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYAP1Q96A49 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYAP1Q96A49 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYAP1Q96A49 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYAP1Q96A49 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYAP1Q96A49 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYAP1Q96A49 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms