Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UTP4Q969X6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
UTP4Q969X6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
UTP4Q969X6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UTP4Q969X6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
UTP4Q969X6 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UTP4Q969X6 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
UTP4Q969X6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UTP4Q969X6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UTP4Q969X6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UTP4Q969X6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UTP4Q969X6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UTP4Q969X6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UTP4Q969X6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UTP4Q969X6 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UTP4Q969X6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UTP4Q969X6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UTP4Q969X6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
UTP4Q969X6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UTP4Q969X6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UTP4Q969X6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UTP4Q969X6 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms