Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SMARCE1Q969G3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms