Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-CQ95604 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms