Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERCC4Q92889 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms