Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EDAQ92838 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDAQ92838 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDAQ92838 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDAQ92838 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDAQ92838 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDAQ92838 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDAQ92838 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDAQ92838 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDAQ92838 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDAQ92838 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDAQ92838 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDAQ92838 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EDAQ92838 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDAQ92838 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDAQ92838 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDAQ92838 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDAQ92838 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDAQ92838 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDAQ92838 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDAQ92838 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDAQ92838 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDAQ92838 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDAQ92838 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDAQ92838 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDAQ92838 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EDAQ92838 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDAQ92838 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDAQ92838 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDAQ92838 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDAQ92838 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDAQ92838 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDAQ92838 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDAQ92838 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDAQ92838 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDAQ92838 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDAQ92838 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDAQ92838 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDAQ92838 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDAQ92838 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDAQ92838 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDAQ92838 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EDAQ92838 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EDAQ92838 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EDAQ92838 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDAQ92838 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDAQ92838 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDAQ92838 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDAQ92838 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDAQ92838 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EDAQ92838 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EDAQ92838 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EDAQ92838 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDAQ92838 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDAQ92838 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDAQ92838 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDAQ92838 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDAQ92838 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDAQ92838 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EDAQ92838 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDAQ92838 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EDAQ92838 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDAQ92838 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDAQ92838 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDAQ92838 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDAQ92838 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDAQ92838 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDAQ92838 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDAQ92838 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDAQ92838 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDAQ92838 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDAQ92838 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDAQ92838 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDAQ92838 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDAQ92838 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDAQ92838 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDAQ92838 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDAQ92838 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDAQ92838 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDAQ92838 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDAQ92838 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDAQ92838 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EDAQ92838 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDAQ92838 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDAQ92838 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDAQ92838 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDAQ92838 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDAQ92838 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDAQ92838 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EDAQ92838 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDAQ92838 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDAQ92838 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDAQ92838 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDAQ92838 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDAQ92838 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDAQ92838 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDAQ92838 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDAQ92838 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDAQ92838 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDAQ92838 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms