Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PHF3Q92576 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PHF3Q92576 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PHF3Q92576 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PHF3Q92576 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF3Q92576 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms